Nagato stringe a se il suo cagnolino e piange, ma Yahiko gli dice che continuando a piangere non cambierà niente.Yahiko vuole cambiare il mondo, e per raggiungere il suo scopo vuole diventare un ninja.
Nagato racconta a Naruto che cominciarono a cercare dei ninja, e trovarono proprio coloro
che combatterono contro Hanzo, tra cui c'era Jiraiya...
In risposta alla richiesta dei bambini Orochimaro propone di ucciderli, per evitare loro la dura vita da orfani.
Jiraiya lo zittisce le dice a lui e a Tsunade che rimarrà con loro finchè non sapranno cavarsela da soli.
Nagato non poteva accettare i ninja di Konoha, ma Jiraiya era diverso.
Un giorno un ninja li attaccò e mandò in fin di vita Yahiko, e Nagato lo sconfisse con il suo potere.
Jiraiya allora decise di farli diventare suoi allievi, e lui aveva capito che era per insegnargli a controllare il Rinnegan.
Ma il senso di colpa che provava era forte e il suo maestro lo salvò
"Non so se sia giusto o sbagliato...
Ma grazie a te, Yahiko è ancora vivo!
L'hai salvato, e questa è una cosa giusta da fare.
Nessuno ti sta incolpando..."
Jiraiya diceva che quando le persone conoscevano il dolore, diventavano più gentili.
Questo dolore fa crescere, ma Nagato non è d'accordo...
"Lui ha provato a cercare questa risposta...
Ma non la trovò...
Proprio come te..."
Nagato voleva proteggere i suoi amici, non gli importava di quanto male avrebbe causato e chiede a Jiraiya a cosa pensa.
Pensa a un modo di cambiare il mondo, vuole la pace, ma non trova la risposta...
Dopo tre anni di allenamenti Jiraiya li lasciò, ma prima di farlo raccontò loro che in passato le nazioni erano in guerra e un uomo riuscì a portare la pace, era chiamato saggio dei sei regni.
Lui trasmetteva la sua religione, e nel tempo la religione si trasformò in tecniche ninja.
Avava il Rinnegan, proprio come Nagato, e Jiraiya vedeva in lui la speranza.
Formarono una banda, e Yahiko ne era il capo.
Hanzo li convinse ad aiutarli per cominciare i trattati di pace tra le nazioni, ma era una trappola, e questa causò la morte di Yahiko.
Hanzo si era messo d'accordo con Danzo per eliminarli, uno veniva aiutato a diventare Hokage, l'altro a mantenere il proprio potere.
Hanno catturato Konan e per salvarla Yahiko deve morire.
Hanzo lancia a Nagato un kunai e gli dice di ucciderlo con quello.
Konan gli dice di non farlo e di scappare, e il ragazzo non sa cosa afre.
"Uccidimi."
Nagato, sconvolto, prende in mano il kunai e Yahiko gli si lancia contro e si colpisce.
"Tu e Konan dovete rimanere vivi in qualche modo...
Tu... sei il messia...
Tu puoi veramente..."
La seconda causa di dolore di Nagato gli fece capire che la sua risposta...
Non aveva alcun valore.
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