Naruto si trova di fronte a Nagato, e vedendolo ricorda i suoi cari uccisi da lui.Pain gli chiede se lo odia e se vuole vendetta e il ragazzo pensa alle parole di God Realm.
Konan dice che anche se ora uccidesse Nagato non cambierebbe nulla, si sentirebbe solo meglio.
Naruto ripensa alle parole di suo padre, mentre Pain gli dice che non può trovare una risposta e che l'unica soluzione è il suo sacrificio per portare la pace nel mondo e scaglia un lungo trasmettitore contro di lui, che non lo schiva e ne rimane trafitto.
Nagato dice che ora può controllarlo facilmente, non l'ha ferito gravemente perchè, come ospite, è importante, ma in risposta riceve solo uno sguardo rabbioso di Naruto, che adesso ha le pupille sia del demone, sia della modalità saggia.
Nagato capisce che si è fatto colpire di proposito e il ragazzo gli dice che vuole capire come si sarebbe sentito vedendolo di persona, e non può perdonarlo.
Si è tolto il trasmettitore e dice che trema dalla voglia di ucciderlo.
Konan non si spiega come faccia a resistere a Nagato da così vicino e Naruto si lancia contro il nemico.
La ragazza si muove per difendere il compagno, ma Naruto ha fermato il suo attacco.
Quando Jiraiya gli parlò del suo sogno non lo prese sul serio, voleva che lui trovasse la risposta, ma Naruto era solo contento della sua approvazione.
Adesso finalmente ha capito il significato di quelle parole, ma Nagato gli dice che nonostante questo Naruto non può perdonarlo, ed è troppo tardi per gli idealismi.
Gli chiede di nuovo se vuole ucciderlo per portare la pace nel mondo, ma è solo una scusa per avere vendetta...
"Se questa è la tua giustizia, va bene.
Non sei Dio."
"Puoi davvero credere ai nonsensi di Jiraiya dopo aver visto la realtà?"
Naruto dice che da quando ha saputo che anche lui era stato suo apprendista voleva sapere cosa lo spinse a tutto questo, non sa niente di lui, vuole sentire la sua storia, prima di dare la risposta.
Nagato acconsente, ma Konan gli dice che è una perdita di tempo.
"Voglio sentire la sua risposta."
Nagato ebbe due grandi fonti di dolore, una è la morte dei suoi genitori.
E' la storia di come Amegakure divenne il campo di battaglia tra i grandi paesi...
Nagato e i suoi genitori sono nascosti in casa e alcuni ninja si sono introdotti nell'abitazione.
Questi hanno trovato del cibo e il padre di Nagato dice di scappare mentre sono distratti.
Purtoppo il bambino fa cadere un vaso e allerta i ninja, suo padre allora cerca di far guadagnare loro tempo per scappare, ma i ninja li prendono per nemici e uccidono i due genitori.
Solo quando vedono Nagato capiscono che erano civili e uno di loro si scusa col bambino, che, piangendo, urla contro di loro con il Rinnegan negli occhi.
